Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZfaP23607 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZfaP23607 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZfaP23607 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZfaP23607 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZfaP23607 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms