Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PparaP23204 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PparaP23204 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PparaP23204 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PparaP23204 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PparaP23204 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PparaP23204 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PparaP23204 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PparaP23204 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PparaP23204 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PparaP23204 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PparaP23204 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PparaP23204 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PparaP23204 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PparaP23204 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PparaP23204 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PparaP23204 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PparaP23204 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PparaP23204 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PparaP23204 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PparaP23204 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PparaP23204 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PparaP23204 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PparaP23204 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PparaP23204 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PparaP23204 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PparaP23204 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PparaP23204 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PparaP23204 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PparaP23204 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PparaP23204 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PparaP23204 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PparaP23204 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PparaP23204 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PparaP23204 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PparaP23204 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PparaP23204 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PparaP23204 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PparaP23204 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PparaP23204 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PparaP23204 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PparaP23204 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PparaP23204 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PparaP23204 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PparaP23204 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PparaP23204 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PparaP23204 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PparaP23204 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PparaP23204 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PparaP23204 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PparaP23204 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PparaP23204 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PparaP23204 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PparaP23204 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PparaP23204 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PparaP23204 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PparaP23204 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PparaP23204 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PparaP23204 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PparaP23204 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PparaP23204 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PparaP23204 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PparaP23204 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PparaP23204 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PparaP23204 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PparaP23204 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PparaP23204 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PparaP23204 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PparaP23204 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PparaP23204 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PparaP23204 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PparaP23204 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PparaP23204 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PparaP23204 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PparaP23204 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PparaP23204 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PparaP23204 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PparaP23204 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PparaP23204 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PparaP23204 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PparaP23204 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PparaP23204 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PparaP23204 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PparaP23204 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PparaP23204 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PparaP23204 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PparaP23204 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PparaP23204 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PparaP23204 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PparaP23204 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PparaP23204 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PparaP23204 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PparaP23204 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PparaP23204 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PparaP23204 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PparaP23204 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PparaP23204 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PparaP23204 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PparaP23204 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PparaP23204 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms