Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif3aP23116 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif3aP23116 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms