Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd3eP22646 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd3eP22646 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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