Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gna11P21278 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gna11P21278 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gna11P21278 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gna11P21278 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gna11P21278 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gna11P21278 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gna11P21278 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gna11P21278 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gna11P21278 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms