Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo5bP21271 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo5bP21271 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo5bP21271 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo5bP21271 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo5bP21271 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo5bP21271 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo5bP21271 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo5bP21271 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo5bP21271 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5bP21271 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5bP21271 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5bP21271 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5bP21271 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5bP21271 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5bP21271 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5bP21271 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5bP21271 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5bP21271 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5bP21271 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5bP21271 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Myo5bP21271 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Myo5bP21271 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Myo5bP21271 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myo5bP21271 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5bP21271 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms