Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnc2P20801 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnc2P20801 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnc2P20801 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnc2P20801 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnc2P20801 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnc2P20801 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc2P20801 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms