Protein–RNA interactions for Protein: P20352

F3, Tissue factor, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P20352 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
F3P20352 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
F3P20352 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F3P20352 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F3P20352 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F3P20352 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F3P20352 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F3P20352 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F3P20352 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F3P20352 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F3P20352 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F3P20352 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F3P20352 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F3P20352 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F3P20352 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F3P20352 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
F3P20352 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
F3P20352 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
F3P20352 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
F3P20352 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
F3P20352 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
F3P20352 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
F3P20352 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
F3P20352 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
F3P20352 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
F3P20352 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
F3P20352 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
F3P20352 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
F3P20352 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
F3P20352 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
F3P20352 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
F3P20352 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
F3P20352 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
F3P20352 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
F3P20352 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
F3P20352 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
F3P20352 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
F3P20352 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
F3P20352 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
F3P20352 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
F3P20352 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
F3P20352 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
F3P20352 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
F3P20352 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
F3P20352 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
F3P20352 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
F3P20352 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
F3P20352 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
F3P20352 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
F3P20352 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F3P20352 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F3P20352 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F3P20352 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F3P20352 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
F3P20352 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
F3P20352 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F3P20352 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F3P20352 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F3P20352 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F3P20352 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F3P20352 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F3P20352 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F3P20352 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
F3P20352 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F3P20352 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
F3P20352 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F3P20352 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
F3P20352 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F3P20352 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F3P20352 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
F3P20352 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
F3P20352 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
F3P20352 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
F3P20352 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
F3P20352 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms