Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfaP20033 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms