Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NelfeP19426 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NelfeP19426 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NelfeP19426 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NelfeP19426 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NelfeP19426 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NelfeP19426 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NelfeP19426 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NelfeP19426 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NelfeP19426 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NelfeP19426 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NelfeP19426 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NelfeP19426 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms