Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl13aP19253 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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