Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps6ka1P18653 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms