Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb1P17919 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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