Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa-rs1P17533 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms