Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkceP16054 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkceP16054 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkceP16054 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkceP16054 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkceP16054 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkceP16054 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkceP16054 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkceP16054 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkceP16054 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms