Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rag1P15919 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rag1P15919 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rag1P15919 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rag1P15919 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rag1P15919 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rag1P15919 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rag1P15919 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rag1P15919 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms