Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dnmt1P13864 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnmt1P13864 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dnmt1P13864 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms