Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd5P13379 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd5P13379 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd5P13379 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd5P13379 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd5P13379 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd5P13379 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd5P13379 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd5P13379 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd5P13379 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd5P13379 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms