Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms