Protein–RNA interactions for Protein: P12815

Pdcd6, Programmed cell death protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6P12815 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd6P12815 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd6P12815 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd6P12815 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd6P12815 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd6P12815 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd6P12815 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd6P12815 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd6P12815 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcd6P12815 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcd6P12815 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcd6P12815 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcd6P12815 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcd6P12815 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd6P12815 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd6P12815 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd6P12815 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd6P12815 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcd6P12815 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcd6P12815 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd6P12815 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd6P12815 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd6P12815 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd6P12815 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms