Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtcP11725 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtcP11725 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtcP11725 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtcP11725 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtcP11725 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtcP11725 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtcP11725 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtcP11725 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtcP11725 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtcP11725 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtcP11725 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtcP11725 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtcP11725 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtcP11725 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtcP11725 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtcP11725 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtcP11725 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtcP11725 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtcP11725 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtcP11725 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtcP11725 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtcP11725 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtcP11725 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtcP11725 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OtcP11725 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OtcP11725 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtcP11725 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtcP11725 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtcP11725 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtcP11725 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtcP11725 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtcP11725 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtcP11725 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtcP11725 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtcP11725 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
OtcP11725 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtcP11725 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtcP11725 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtcP11725 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtcP11725 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtcP11725 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtcP11725 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtcP11725 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtcP11725 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtcP11725 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtcP11725 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtcP11725 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtcP11725 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtcP11725 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtcP11725 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtcP11725 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OtcP11725 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtcP11725 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtcP11725 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtcP11725 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtcP11725 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OtcP11725 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtcP11725 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtcP11725 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtcP11725 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtcP11725 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtcP11725 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtcP11725 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtcP11725 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtcP11725 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtcP11725 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtcP11725 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtcP11725 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtcP11725 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtcP11725 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtcP11725 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtcP11725 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtcP11725 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtcP11725 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OtcP11725 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OtcP11725 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtcP11725 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtcP11725 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtcP11725 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtcP11725 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtcP11725 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtcP11725 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtcP11725 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OtcP11725 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OtcP11725 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OtcP11725 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OtcP11725 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OtcP11725 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtcP11725 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtcP11725 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtcP11725 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtcP11725 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OtcP11725 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtcP11725 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OtcP11725 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtcP11725 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtcP11725 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtcP11725 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtcP11725 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms