Protein–RNA interactions for Protein: P10855

Ccl3, C-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl3P10855 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl3P10855 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms