Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Schip1P0DPB4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms