Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf1P09925 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf1P09925 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf1P09925 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf1P09925 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf1P09925 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf1P09925 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf1P09925 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Surf1P09925 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Surf1P09925 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf1P09925 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf1P09925 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf1P09925 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf1P09925 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf1P09925 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms