Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa9P09631 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms