Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxb5P09079 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxb5P09079 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hoxb5P09079 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hoxb5P09079 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hoxb5P09079 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hoxb5P09079 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hoxb5P09079 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Hoxb5P09079 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Hoxb5P09079 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Hoxb5P09079 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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