Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spta1P08032 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spta1P08032 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spta1P08032 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spta1P08032 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spta1P08032 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spta1P08032 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spta1P08032 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Spta1P08032 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms