Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtnd1P03888 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms