Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01680 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01680 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01680 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01680 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01680 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01680 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01680 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01680 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01680 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01680 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01680 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01680 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01680 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01680 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01680 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01680 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01680 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01680 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01680 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01680 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01680 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01680 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01680 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01680 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01680 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01680 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01680 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01680 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01680 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01680 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01680 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01680 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01680 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01680 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01680 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01680 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01680 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01680 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01680 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01680 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01680 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01680 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01680 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01680 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01680 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01680 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01680 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01680 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01680 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01680 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01680 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01680 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01680 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01680 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01680 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01680 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01680 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01680 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01680 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01680 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01680 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01680 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01680 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01680 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01680 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01680 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01680 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01680 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01680 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01680 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01680 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01680 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01680 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01680 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01680 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01680 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01680 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01680 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01680 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01680 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01680 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01680 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01680 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01680 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01680 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01680 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01680 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01680 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01680 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01680 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01680 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01680 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01680 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01680 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01680 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01680 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01680 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01680 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01680 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms