Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01655 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01655 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01655 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01655 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01655 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01655 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01655 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01655 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01655 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01655 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01655 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01655 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01655 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01655 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01655 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01655 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01655 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01655 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01655 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01655 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01655 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01655 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01655 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01655 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01655 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01655 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01655 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01655 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01655 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01655 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01655 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01655 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01655 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01655 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01655 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01655 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01655 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01655 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01655 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01655 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01655 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01655 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01655 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01655 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01655 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01655 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01655 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01655 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms