Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01649 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P01649 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01649 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01649 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01649 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01649 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01649 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01649 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01649 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01649 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01649 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01649 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01649 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01649 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01649 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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P01649 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01649 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01649 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01649 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01649 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01649 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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P01649 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01649 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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P01649 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01649 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01649 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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P01649 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01649 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01649 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01649 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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P01649 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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P01649 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01649 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01649 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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P01649 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01649 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01649 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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P01649 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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P01649 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01649 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01649 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01649 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01649 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01649 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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P01649 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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P01649 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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P01649 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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P01649 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01649 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01649 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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P01649 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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P01649 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01649 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01649 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01649 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01649 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01649 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01649 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01649 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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