Protein–RNA interactions for Protein: P01193

Pomc, Pro-opiomelanocortin, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomcP01193 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PomcP01193 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PomcP01193 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PomcP01193 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PomcP01193 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PomcP01193 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PomcP01193 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PomcP01193 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PomcP01193 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PomcP01193 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PomcP01193 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PomcP01193 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PomcP01193 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PomcP01193 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PomcP01193 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PomcP01193 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PomcP01193 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PomcP01193 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PomcP01193 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PomcP01193 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PomcP01193 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PomcP01193 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PomcP01193 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PomcP01193 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PomcP01193 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PomcP01193 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PomcP01193 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PomcP01193 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PomcP01193 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PomcP01193 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PomcP01193 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PomcP01193 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PomcP01193 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PomcP01193 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PomcP01193 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PomcP01193 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PomcP01193 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PomcP01193 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PomcP01193 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PomcP01193 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PomcP01193 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PomcP01193 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PomcP01193 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PomcP01193 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PomcP01193 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PomcP01193 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PomcP01193 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PomcP01193 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PomcP01193 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PomcP01193 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PomcP01193 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PomcP01193 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PomcP01193 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PomcP01193 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PomcP01193 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PomcP01193 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PomcP01193 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PomcP01193 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PomcP01193 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PomcP01193 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PomcP01193 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PomcP01193 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PomcP01193 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PomcP01193 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PomcP01193 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PomcP01193 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PomcP01193 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PomcP01193 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PomcP01193 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PomcP01193 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PomcP01193 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PomcP01193 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PomcP01193 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PomcP01193 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PomcP01193 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms