Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms