Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Apaf1O88879 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms