Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcn2O88703 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms