Protein–RNA interactions for Protein: O88676

Mmp23, Matrix metalloproteinase-23, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp23O88676 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Mmp23O88676 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Mmp23O88676 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Mmp23O88676 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Mmp23O88676 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Mmp23O88676 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Mmp23O88676 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Mmp23O88676 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp23O88676 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mmp23O88676 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mmp23O88676 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mmp23O88676 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mmp23O88676 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp23O88676 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp23O88676 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp23O88676 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp23O88676 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp23O88676 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp23O88676 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp23O88676 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp23O88676 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp23O88676 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp23O88676 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp23O88676 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp23O88676 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp23O88676 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Mmp23O88676 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp23O88676 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp23O88676 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp23O88676 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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