Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops3O88543 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops3O88543 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops3O88543 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops3O88543 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops3O88543 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops3O88543 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops3O88543 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops3O88543 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops3O88543 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms