Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnmt3aO88508 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3aO88508 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms