Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AvilO88398 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AvilO88398 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AvilO88398 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AvilO88398 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AvilO88398 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AvilO88398 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AvilO88398 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AvilO88398 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AvilO88398 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AvilO88398 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AvilO88398 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AvilO88398 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AvilO88398 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AvilO88398 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AvilO88398 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AvilO88398 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AvilO88398 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AvilO88398 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AvilO88398 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AvilO88398 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AvilO88398 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AvilO88398 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AvilO88398 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AvilO88398 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AvilO88398 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AvilO88398 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AvilO88398 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AvilO88398 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AvilO88398 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AvilO88398 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AvilO88398 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AvilO88398 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AvilO88398 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AvilO88398 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AvilO88398 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AvilO88398 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AvilO88398 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AvilO88398 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AvilO88398 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AvilO88398 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AvilO88398 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AvilO88398 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AvilO88398 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AvilO88398 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AvilO88398 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AvilO88398 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AvilO88398 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AvilO88398 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AvilO88398 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AvilO88398 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AvilO88398 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AvilO88398 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AvilO88398 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AvilO88398 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AvilO88398 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AvilO88398 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AvilO88398 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AvilO88398 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AvilO88398 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AvilO88398 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AvilO88398 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AvilO88398 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AvilO88398 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AvilO88398 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AvilO88398 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AvilO88398 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AvilO88398 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AvilO88398 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AvilO88398 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AvilO88398 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AvilO88398 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AvilO88398 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AvilO88398 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AvilO88398 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AvilO88398 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AvilO88398 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AvilO88398 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AvilO88398 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AvilO88398 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AvilO88398 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AvilO88398 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AvilO88398 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AvilO88398 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AvilO88398 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AvilO88398 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AvilO88398 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AvilO88398 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AvilO88398 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AvilO88398 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AvilO88398 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AvilO88398 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AvilO88398 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AvilO88398 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AvilO88398 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AvilO88398 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AvilO88398 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AvilO88398 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AvilO88398 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AvilO88398 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms