Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfdp1O88271 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms