Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a1O88207 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a1O88207 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a1O88207 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a1O88207 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a1O88207 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a1O88207 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a1O88207 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a1O88207 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a1O88207 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a1O88207 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a1O88207 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a1O88207 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a1O88207 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a1O88207 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a1O88207 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col5a1O88207 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms