Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaskO70589 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaskO70589 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CaskO70589 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaskO70589 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaskO70589 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaskO70589 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaskO70589 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaskO70589 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaskO70589 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaskO70589 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaskO70589 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaskO70589 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaskO70589 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaskO70589 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CaskO70589 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaskO70589 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaskO70589 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaskO70589 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CaskO70589 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaskO70589 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaskO70589 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaskO70589 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaskO70589 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaskO70589 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaskO70589 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaskO70589 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaskO70589 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaskO70589 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CaskO70589 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaskO70589 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaskO70589 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaskO70589 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaskO70589 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaskO70589 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaskO70589 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaskO70589 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaskO70589 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaskO70589 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaskO70589 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaskO70589 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaskO70589 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaskO70589 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaskO70589 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaskO70589 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaskO70589 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaskO70589 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaskO70589 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaskO70589 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaskO70589 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaskO70589 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaskO70589 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaskO70589 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaskO70589 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaskO70589 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaskO70589 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaskO70589 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaskO70589 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaskO70589 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaskO70589 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaskO70589 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaskO70589 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaskO70589 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CaskO70589 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaskO70589 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaskO70589 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaskO70589 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaskO70589 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaskO70589 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaskO70589 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaskO70589 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CaskO70589 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaskO70589 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms