Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CtssO70370 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtssO70370 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtssO70370 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtssO70370 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtssO70370 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtssO70370 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtssO70370 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtssO70370 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CtssO70370 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtssO70370 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtssO70370 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtssO70370 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtssO70370 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtssO70370 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtssO70370 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtssO70370 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtssO70370 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtssO70370 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtssO70370 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtssO70370 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtssO70370 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtssO70370 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtssO70370 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtssO70370 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtssO70370 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtssO70370 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtssO70370 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtssO70370 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CtssO70370 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CtssO70370 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CtssO70370 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtssO70370 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtssO70370 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtssO70370 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtssO70370 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtssO70370 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtssO70370 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtssO70370 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtssO70370 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtssO70370 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtssO70370 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtssO70370 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CtssO70370 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtssO70370 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtssO70370 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtssO70370 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtssO70370 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtssO70370 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtssO70370 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtssO70370 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtssO70370 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtssO70370 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtssO70370 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtssO70370 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtssO70370 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtssO70370 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtssO70370 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtssO70370 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtssO70370 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtssO70370 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtssO70370 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtssO70370 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtssO70370 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtssO70370 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtssO70370 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtssO70370 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtssO70370 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtssO70370 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtssO70370 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtssO70370 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtssO70370 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CtssO70370 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtssO70370 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtssO70370 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtssO70370 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CtssO70370 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtssO70370 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtssO70370 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtssO70370 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CtssO70370 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtssO70370 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtssO70370 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtssO70370 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtssO70370 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtssO70370 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtssO70370 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtssO70370 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtssO70370 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtssO70370 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtssO70370 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CtssO70370 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtssO70370 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtssO70370 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtssO70370 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CtssO70370 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtssO70370 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtssO70370 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtssO70370 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtssO70370 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms