Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgceO70258 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgceO70258 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgceO70258 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgceO70258 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgceO70258 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgceO70258 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgceO70258 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgceO70258 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgceO70258 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgceO70258 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgceO70258 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgceO70258 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgceO70258 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgceO70258 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgceO70258 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgceO70258 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgceO70258 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgceO70258 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgceO70258 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgceO70258 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgceO70258 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgceO70258 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgceO70258 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgceO70258 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgceO70258 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SgceO70258 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgceO70258 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgceO70258 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgceO70258 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgceO70258 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SgceO70258 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgceO70258 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SgceO70258 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgceO70258 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgceO70258 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgceO70258 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgceO70258 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgceO70258 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgceO70258 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgceO70258 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgceO70258 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgceO70258 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgceO70258 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgceO70258 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgceO70258 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgceO70258 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgceO70258 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgceO70258 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgceO70258 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgceO70258 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgceO70258 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgceO70258 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgceO70258 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgceO70258 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgceO70258 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgceO70258 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgceO70258 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgceO70258 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgceO70258 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgceO70258 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgceO70258 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgceO70258 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgceO70258 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgceO70258 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgceO70258 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgceO70258 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgceO70258 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SgceO70258 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgceO70258 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgceO70258 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgceO70258 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SgceO70258 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgceO70258 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgceO70258 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgceO70258 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgceO70258 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgceO70258 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgceO70258 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgceO70258 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgceO70258 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgceO70258 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SgceO70258 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgceO70258 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgceO70258 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgceO70258 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgceO70258 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgceO70258 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgceO70258 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgceO70258 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgceO70258 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgceO70258 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgceO70258 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgceO70258 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgceO70258 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgceO70258 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgceO70258 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgceO70258 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgceO70258 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgceO70258 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms