Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb5O55234 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms