Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ChadO55226 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ChadO55226 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ChadO55226 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChadO55226 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChadO55226 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChadO55226 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChadO55226 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChadO55226 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChadO55226 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChadO55226 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChadO55226 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChadO55226 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChadO55226 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChadO55226 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChadO55226 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChadO55226 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChadO55226 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChadO55226 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChadO55226 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChadO55226 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChadO55226 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChadO55226 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChadO55226 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ChadO55226 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChadO55226 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChadO55226 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChadO55226 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChadO55226 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChadO55226 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChadO55226 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ChadO55226 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ChadO55226 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChadO55226 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChadO55226 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChadO55226 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChadO55226 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChadO55226 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChadO55226 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChadO55226 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChadO55226 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChadO55226 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChadO55226 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChadO55226 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChadO55226 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChadO55226 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChadO55226 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChadO55226 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChadO55226 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChadO55226 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChadO55226 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChadO55226 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChadO55226 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChadO55226 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChadO55226 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChadO55226 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChadO55226 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChadO55226 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChadO55226 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChadO55226 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChadO55226 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ChadO55226 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ChadO55226 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChadO55226 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChadO55226 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChadO55226 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChadO55226 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChadO55226 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChadO55226 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChadO55226 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChadO55226 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChadO55226 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChadO55226 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChadO55226 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChadO55226 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChadO55226 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChadO55226 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChadO55226 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChadO55226 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChadO55226 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChadO55226 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChadO55226 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChadO55226 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChadO55226 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChadO55226 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChadO55226 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChadO55226 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChadO55226 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChadO55226 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChadO55226 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChadO55226 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChadO55226 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChadO55226 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChadO55226 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChadO55226 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChadO55226 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ChadO55226 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChadO55226 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChadO55226 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChadO55226 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms