Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Supt5hO55201 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms