Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx4O55187 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms