Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx3O55144 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms