Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms